Apktool(v2.0.0rc3) 解由最新的build-tools(v21.x) 所编译的Apk,如果其引用了Android Lollipop的Material主题,会出现资源引用偏移的情况。
values-v21文件夹下的styles.xml中的主题原来是:

<style name="AppBaseTheme" parent="@android:style/Theme.Material.Light">

解包后却变成

<style name="AppBaseTheme" parent="@android:style/Widget.Holo.DateTimePicker">

##原因
Apktool decode 某个Apk首先需要加载 packageandroid (其package id一般为0x01[1]) 的资源映射表(Resource Table),这就是第一次运行Apktool会安装内置资源包resources.arscxxx/apktool/framework/1.apk的原因[2]

可想而知,如果这个资源包没有及时升级,自然就会导致资源引用偏移甚至解包失败:

Exception in thread "main" brut.androlib.err.UndefinedResObject:resource spec: 0x01...

##解决办法

删除这个framework资源包让它自动安装最新的即可。
路径一般是

$HOME/apktool/framework/1.apk

或者(OSX)

$HOME/Library/apktool/framework/1.apk

##Reference

  1. How aapt mapping resource ID: http://stackoverflow.com/a/6646113/2236255
  2. Why need framework: https://code.google.com/p/android-apktool/wiki/FrameworkFiles